Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HmgcrQ01237 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms