Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col1a2Q01149 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col1a2Q01149 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms