Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde1bQ01065 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde1bQ01065 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms