Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms