Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbp4Q00724 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbp4Q00724 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms