Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga4Q00651 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms