Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Il6stQ00560 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Il6stQ00560 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms