Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8a1Q00558 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8a1Q00558 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms