Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcf7Q00417 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf7Q00417 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms