Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms