Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp10Q000W5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms