Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms