Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp6P97868 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp6P97868 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms