Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smn1P97801 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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