Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms