Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms