Protein–RNA interactions for Protein: P97464

Ext1, Exostosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext1P97464 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext1P97464 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms