Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas1P97459 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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