Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smyd1P97443 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms