Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nbr1P97432 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms