Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhodP97348 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhodP97348 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhodP97348 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms