Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mesp1P97309 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mesp1P97309 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms