Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms