Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms