Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms