Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms