Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf1P81269 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf1P81269 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf1P81269 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf1P81269 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf1P81269 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms