Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cct5P80316 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cct5P80316 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms