Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tp53bp1P70399 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms