Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfi1P70338 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfi1P70338 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms