Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx1P70314 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx1P70314 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms