Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux2P70298 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux2P70298 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux2P70298 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux2P70298 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux2P70298 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms