Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp3P70281 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms