Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stra8P70278 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stra8P70278 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra8P70278 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra8P70278 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra8P70278 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra8P70278 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms