Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf5P70191 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf5P70191 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf5P70191 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms