Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acta1P68134 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Acta1P68134 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms