Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpnP63163 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpnP63163 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms