Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnab1P63143 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnab1P63143 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms