Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtnP63089 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtnP63089 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtnP63089 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtnP63089 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtnP63089 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtnP63089 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtnP63089 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtnP63089 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtnP63089 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtnP63089 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms