Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps3P62908 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps3P62908 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps3P62908 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms