Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms