Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd1P62315 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms