Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm3P62311 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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