Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms