Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms