Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl27P61358 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms