Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2kP61087 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2kP61087 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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