Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms