Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rin3P59729 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms