Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdhd1P59328 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Wdhd1P59328 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdhd1P59328 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdhd1P59328 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms